《菌物系统》是中国菌物学会主办，中科院微生物所承办，由科学出版社出版的全国性学术期刊。《菌物系统》是原《真菌学报》与原《Mycosystema》(菌物系统)合刊的刊名。

　　原《真菌学报》1982年创刊(季刊)，是我国真菌学唯一的学报级综合性学术期刊;原《菌物系统》1988年创刊，是菌物学会主办的学术年刊，该刊在全世界三十多个国家和地区发行和交换，是国际菌物学界信赖的刊物之一，已被国际权威工具书“The Dictionary of Fungi”最新版本(1995，p.254)收录。

　　从1997年起，由于“真菌”一词的意义不能包涵全部的菌物(真菌、粘菌、卵菌)，因此顺应国际名词的涵义，将《真菌学报》与《菌物系统》合并，更名为《菌物系统》，办刊宗旨及报道范围未变，卷期延续原《真菌学报》。

　　本刊仍是菌物学及其分支学科的综合性学术期刊。主要刊登我国菌物学领域在理论上、实践上有创造性的科研成果及研究论文、简报等。内容包括：1.菌物系统学、分类学、形态学、分子与细胞水平的进化菌物学、菌物区系地理学、菌物多样性等。我国95%以上菌物新种、新记录通过我刊向全世界报道。2.菌物资源开发利用。3.真菌遗传。4.共生作用(菌根、地衣)。5.真菌毒素。6.食用药用真菌。7.致病真菌(人、动物、植物)。8.工业真菌(发酵、酶、多糖、制药等)。9.菌物学研究的新方法、新技术等。

　　《菌物系统》(原《真菌学报》)经历届编委会和编辑人员的努力，质量不断提高，达到了本学科国内一流水平，在国际上也有一定影响，已被7种世界性检索期刊和5种国内检索期刊和数据库(中国科技信息研究所数据库、中科院文献情报中心《中国科学引文数据库》、《中国农业文摘》、《中国生物学文摘》、

　　《中国学术期刊文摘》)收录， 被列入中文核心期刊(生物学、微生物学------和植物学类。 准期率100%。

　　合刊后的《菌物系统》立足本国，面向世界，稿源丰富，质量较高，版式精美。 在所刊论文中，国家自然科学基金、攻关项目、863高技术项目以及其他各项基金资助项目的论文占总刊稿量的80%以上，获奖论文占刊稿总数的20%，基本上反映了我国菌物学领域的最高学术水平。 促进了国内外学术交流，也为国民经济建设作出了贡献，深受国内外学者好评。

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